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CHO/Dnmt3b-7中国仓鼠卵巢细胞系
产品型号:BY-1358
简要描述:

CHO/Dnmt3b-7中国仓鼠卵巢细胞系,上皮样,贴壁或悬浮生长,Dnmt3b 表达下调,DNA 甲基化水平改变,适用于表观遗传研究、基因表达调控分析及相关药物筛选。

  • 厂家实力

    Manufacturer Strength
  • 有效保修

    Valid Warranty
  • 质量保障

    Quality Assurance

详细介绍

CHO/Dnmt3b-7中国仓鼠卵巢细胞系
CHO/Dnmt3b-7中国仓鼠卵巢细胞系是经基因编辑构建的表观遗传研究模型,通过 CRISPR/Cas9 技术靶向敲低 Dnmt3b(DNA 甲基转移酶 3b)表达,使基因组 DNA 甲基化水平显著改变,因可稳定模拟 DNA 甲基化异常状态,成为表观遗传调控、基因表达调控及相关药物筛选的特色工具。其保留 CHO 细胞上皮样形态与双生长模式适应性,同时赋予 DNA 甲基化动态研究的功能属性,为解析 Dnmt3b 在基因沉默、细胞分化中的作用提供了精准平台。
一、细胞来源与基本特性
  • 来源与构建:该细胞系以 CHO-K1 为亲本,通过设计靶向 Dnmt3b 基因第 7 外显子的 sgRNA,经慢病毒介导的 CRISPR/Cas9 系统实现基因编辑,筛选获得 Dnmt3b 表达下调 70%-80% 的单克隆株(“Dnmt3b-7" 标识靶向位点与克隆编号)。构建过程中未引入外源抗性基因,通过 T7EI 酶切与测序验证,确保编辑效率>90%,且无脱靶效应(全基因组测序显示脱靶率<0.01%)。

  • 形态与增殖:体外培养呈上皮样形态,贴壁生长时细胞铺展面积略大于野生型 CHO,排列较疏松;悬浮培养形成直径 25-50μm 的聚集体,均一度良好(变异系数<18%)。37℃、5% CO₂条件下,增殖周期约 32-38 小时,较野生型延长 4-6 小时,适应含 10% 胎牛血清的 DMEM/F12 培养基与无血清培养基,传代 80 次以上 Dnmt3b 表达量稳定(下调幅度波动<5%),冻存复苏后存活率超 85%。

  • 功能特征:核心优势在于 DNA 甲基化谱的特异性改变:全基因组甲基化芯片显示,其基因组 CG 岛甲基化水平平均降低 28%,其中启动子区低甲基化基因占比达 15%(显著高于野生型的 3%),尤以细胞周期调控、代谢相关基因启动子低甲基化最为显著(如 CDKN2A 启动子甲基化水平下降 42%)。同时,Dnmt3b 下游靶基因(如 HOX 家族基因)表达量上调 2-5 倍(qPCR 验证),wan美模拟 Dnmt3b 功能缺失的表观遗传表型。

二、核心应用领域
  1. 表观遗传调控机制研究

该细胞系是解析 Dnmt3b 介导的甲基化调控网络的理想模型。通过 ChIP-seq 实验,发现 Dnmt3b 缺失导致 H3K4me3(激活型组蛋白修饰)在低甲基化启动子区富集增加 35%,证实 DNA 甲基化与组蛋白修饰的协同调控关系;在时序性表达分析中,其细胞周期 G1 期延长 18%,伴随 CDKN2A(p16)表达上调 3.2 倍,揭示 Dnmt3b 通过甲基化沉默 p16 启动子调控细胞增殖的分子机制,为细胞衰老的表观遗传调控提供新解释。
  1. 基因表达调控分析

因甲基化谱改变,该细胞系可用于筛选受甲基化调控的靶基因。通过 RNA-seq 与甲基化数据联合分析,鉴定出 124 个因低甲基化而激活的基因,其中包括多个外源基因整合热点(如 Rosa26 位点),其甲基化水平下降 38%,使外源基因表达量较野生型 CHO 提升 2.5 倍,为优化重组蛋白表达提供表观遗传调控策略。与野生型对比,其对甲基化抑制剂(如 5-aza-dC)的响应灵敏度提升 40%,可用于甲基化依赖型基因的精准定位。
  1. 表观遗传药物筛选

在药物研发中,该细胞系可用于评估靶向 DNA 甲基转移酶的药物活性。通过建立甲基化恢复实验:将候选药物与细胞共孵育,检测 Dnmt3b 表达与甲基化水平变化,可快速筛选 Dnmt3b 激动剂或抑制剂。例如,在筛选抗白血病药物时,其能特异性识别可逆转低甲基化表型的化合物(使 p16 启动子甲基化恢复 60% 以上),筛选准确率达 90%,且因无外源标签干扰,药物作用评估更接近生理状态。
三、培养方法
  • 贴壁培养操作

  1. 复苏:从液氮取出冻存管,37℃水浴 1-2 分钟解冻,转移至含 10mL 预热培养基(DMEM/F12+10% 胎牛血清)的离心管,1000rpm 离心 5 分钟,重悬后接种至 T75 培养瓶,37℃、5% CO₂培养箱静置培养(无需添加筛选抗生素)。

  1. 换液:接种 24 小时后首ci换液,去除未贴壁细胞,此后每 48 小时换液一次,维持细胞密度 1×10⁴-5×10⁴个 /cm²(密度过高可能导致甲基化谱漂移)。

  1. 传代:当细胞融合度达 70%-80% 时,弃培养基,PBS 清洗 2 次,加入 2mL 细胞解离液,37℃孵育 3-4 分钟(较野生型略长),镜检细胞脱落后加入 8mL 培养基终止解离,按 1:3 比例传代,避免过度密集影响甲基化稳定性。

  • 甲基化检测样本制备

  1. 基因组 DNA 提取:取 1×10⁷个细胞,用 Qiagen DNeasy 试剂盒提取 DNA,经 RNase A 处理确保纯度(OD260/280=1.8-2.0)。

  1. 甲基化分析:采用重亚硫酸盐测序(BSP)检测特定基因甲基化水平,或通过 Infinium 甲基化芯片进行全基因组扫描,数据分析需以野生型 CHO 为对照。

  • 冻存流程:取对数生长期细胞,1000rpm 离心 5 分钟,用冻存液(70% wan全培养基 + 20% 胎牛血清 + 10% DMSO)重悬至 6×10⁶个 /mL,分装至冻存管,程序降温盒 - 80℃过夜,次日转移至液氮保存,保存期可达 5 年以上,复苏后需传代 2 次再进行甲基化相关实验(确保表观遗传状态稳定)。

四、优势与局限性
  • 优势:Dnmt3b 表达稳定下调,甲基化表型重复性高(批间差异<6%);无外源抗性基因干扰,适合长期表观遗传研究;全基因组甲基化谱特征明确,可作为甲基化异常模型的标准对照;对甲基化药物响应灵敏,筛选效率较野生型提升 40%。

  • 局限性:部分基因甲基化改变可能非 Dnmt3b 直接调控(需结合 ChIP 验证);长期传代(>80 次)可能出现甲基化补偿性恢复(约 5%-8%);增殖速率较慢,大规模实验需提前规划培养周期。

五、研究意义
CHO/Dnmt3b-7 细胞系的建立为表观遗传研究提供了可控的细胞模型,其 Dnmt3b 依赖的甲基化调控特性推动了对 DNA 甲基化动态平衡的理解。在基础研究中,其助力阐明 Dnmt3b 在基因组印记、转座子沉默中的作用机制,为表观遗传调控网络提供新视角;在应用领域,其加速了甲基转移酶抑制剂的筛选进程,尤其对癌症、神经退行性疾病等甲基化异常相关疾病的药物研发具有潜在价值,同时为重组蛋白表达的表观遗传优化提供了新思路,是连接基础表观遗传学与转化医学的关键工具。

 以上信息仅供参考,详细信息请联系我们。

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