技术文章
TECHNICAL ARTICLES详细介绍
来源与构建:该细胞系以 CHO-K1 为亲本,通过 CRISPR/Cas9 介导的碱基编辑技术实现 H3K181 位点的定点修饰,筛选获得 H3K181a 修饰稳定异常的单克隆株(“JJ-9-H3K181a" 标识构建批次、克隆编号与靶标修饰位点)。构建过程中未引入外源抗性基因,通过 Western blot 与质谱验证,确保 H3K181a 修饰水平较野生型改变 40%-60%,且其他组蛋白位点修饰无显著变化(如 H3K4me3、H3K27ac 波动<5%),避免非特异性表观遗传干扰。
形态与增殖:体外培养呈上皮样形态,贴壁生长时细胞轮廓清晰,较野生型 CHO 略大且排列疏松;因染色质功能改变,悬浮培养适应性较差,主要以贴壁方式培养。37℃、5% CO₂条件下,增殖周期约 38-44 小时,较野生型延长 8-10 小时,适应含 10% 胎牛血清的 DMEM/F12 培养基,传代 60 次以上 H3K181a 修饰表型稳定(波动<7%),冻存复苏后存活率超 83%。
功能特征:核心优势在于组蛋白修饰的特异性改变:H3K181a 修饰异常导致染色质开放度改变(ATAC-seq 显示 12% 的基因组区域 accessibility 变化),其中启动子区开放度差异zui显著(上调区域占 8%,下调区域占 15%)。ChIP-seq 验证显示,H3K181a 修饰与 RNA 聚合酶 II 结合效率呈正相关(R²=0.78),使下游靶基因(如细胞周期调控基因 CDK6)表达量改变 2-4 倍,wan美模拟组蛋白修饰介导的基因表达调控表型。
表观遗传调控机制研究
染色质动态分析
组蛋白靶向药物筛选
贴壁培养操作:
复苏:从液氮取出冻存管,37℃水浴 1-2 分钟解冻,转移至含 10mL 预热培养基(DMEM/F12+10% 胎牛血清)的离心管,1000rpm 离心 5 分钟,重悬后接种至 T75 培养瓶,37℃、5% CO₂培养箱静置培养。
换液:接种 24 小时后首ci换液,去除未贴壁细胞,此后每 48 小时换液一次,维持细胞融合度<70% 以保证表观遗传状态稳定。
传代:当细胞融合度达 60%-70% 时,弃培养基,PBS 清洗 2 次,加入 2mL 细胞解离液,37℃孵育 3-4 分钟,镜检细胞脱落后加入 8mL 培养基终止解离,按 1:4 比例传代,避免过度密集导致修饰表型漂移。
修饰检测样本制备:
蛋白提取:取 5×10⁶个细胞,用 RIPA 裂解液提取核蛋白,BCA 法定量后调整浓度至 1μg/μL。
修饰检测:通过 Western blot 检测 H3K181a 修饰水平(一抗选用特异性识别异常修饰的抗体),以总 H3 蛋白为内参,计算相对表达量(建议每 20 代检测一次以验证稳定性)。
冻存流程:取对数生长期细胞,1000rpm 离心 5 分钟,用冻存液(70% wan全培养基 + 20% 胎牛血清 + 10% DMSO)重悬至 5×10⁶个 /mL,分装至冻存管,程序降温盒 - 80℃过夜,次日转移至液氮保存,保存期可达 5 年以上,复苏后需传代 2-3 次再进行表观遗传相关实验(确保修饰状态稳定)。
优势:H3K181a 修饰异常特异性高,其他组蛋白位点干扰<5%;表观遗传表型稳定,传代 60 次修饰水平波动<7%;无外源基因整合,适合长期机制研究;对组蛋白修饰药物响应灵敏,筛选效率较野生型提升 35%。
局限性:部分基因表达改变可能间接受染色质结构影响(需结合 ChIP 验证直接调控关系);贴壁依赖性强,悬浮培养会导致修饰表型改变(约 10%);部分实验需配套野生型对照(如 H3K181 正常修饰的 CHO 细胞)以排除背景干扰。
以上信息仅供参考,详细信息请联系我们。
产品咨询
相关产品
型号:BY-1362
型号:BY-1362
型号:BY-1362
型号:BY-1362
Copyright©2025 上海乾思生物科技有限公司 版权所有 备案号:沪ICP备2023041625号-7 sitemap.xml 技术支持:化工仪器网 管理登陆